E' attualmente consulente presso Europe Economics, una società di consulenza economica con sede a Londra. In precedenza ha lavorato come consulente per numerose organizzazioni italiane ed internazionali. Matteo Aquilina ha ottenuto un Dottorato in Economia Politica presso l'Università di Roma Tre nel 2006 ed un Master in Economia dello Sviluppo presso l'Università di Oxford nel 2002.